La méthodologie de la planification participative comprend trois moments importants en ce qui concerne la participation citoyenne: le diagnostique participatif, la récupération des demandes et leur priorisation. Si dans certaines municipalités les Plans de Développement Municipaux sont réalisés de manière plus ou moins participative, dans d'autres le travail est confié à des entreprises de consultance qui élaborent le document sans travail de terrain ni consultation avec les organisations de base. Dans la pratique, la plupart des municipalités procèdent tout au plus à la récupération des demandes de façon participative, alors que le diagnostique et la priorisation sont généralement le fait des techniciens de la mairie ou d'entreprises de consultance.

Malgré les nombreux efforts réalisés pour tenter d'améliorer la qualité des processus de planification participative, la qualité de la participation laisse encore souvent à désirer, en particulier en ce qui concerne la participation des femmes et des groupes les plus défavorisés.